另外，在煤矸石堆放時可以摻入惰性粉狀物料作為充填材料，以阻隔空氣與矸石的接觸。目前來看電廠排出的通過小型煤矸石粉碎機的粉煤灰是一種較理想的填充材料，粉煤灰的顆粒較細，可以填充煤矸石中較大的空隙，可對煤矸石的綜合利用提高，達到改善煤矸石的物理性狀，減少空氣的流通，降低自燃發(fā)生的概率。同時還可以廢治廢，有效降低復(fù)墾成本。

微生物脫硫煤矸石山治理較根本的就是要解決矸石中硫的問題，這是矸石山治理的關(guān)鍵。目前發(fā)現(xiàn)，能夠脫去黃鐵礦中無機硫的微生物有氧化亞鐵硫桿菌、氧化硫硫桿菌等。利用微生物脫硫，一方面能把單體硫變成硫酸，有效脫除煤中的無機硫，同時釋放出H+，進入到礦堆流出的水中；另一方面也可以將Fe2+氧化成Fe3十，F(xiàn)e3+在水中發(fā)生水解，形成Fe(OH)3，向水中釋放更多的H+。大量H+的釋放，降低了環(huán)境的pH，而硫化物氧化細菌“鐵氧化硫桿菌”在低pH的環(huán)境下會進一步加速硫和鐵的氧化過程。據(jù)國外報道，使用像氧化亞鐵硫桿菌這樣的硫鐵礦氧化生物對煤進行微生物脫硫，30天內(nèi)黃鐵礦硫的脫除率可達90％左右。采用微生物脫硫，技術(shù)簡單，成本低，更符合環(huán)保新理念，是很有前途的污染治理方法。

雖然硫桿菌有較好的脫硫效果，但會引起矸石山的酸化，而且Fe(OH)3會從水中析出，沉淀到河床上，幾乎可以殺死所有在河底生長的水生生物，因而需要與能夠中和多余酸的堿性物質(zhì)(如粉煤灰)同時使用，粉煤灰可提高土壤pH、改變土壤質(zhì)地、增加土壤持水量和土壤的肥力。

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